在阅读一些生物代谢物研究的文献过程中,我们经常会遇到一些分子的结构式,如下面两篇文章的真菌毒素(稻曲菌素)和木犀草素(Luteolin)的结构式。
(Food Control,2018)
(Cell death & disease,原由网2017)
那么如何绘制这样的结构式呢?当然国外非常有名的ChemDraw软件可以做到,但软件非常贵,今天给大家介绍一款完全免费的软件——InDraw,完全可以用于教学、科研的作图,还原由网可以进行药物设计。
软件下载
InDraw 是Integle 公司(一家中国公司)开发的结构式编辑器,有网页版和桌面客原由网户端两种形式,公司称永久免费。可应用于化学、医药和生物等领域,并具有化学结构式搜索服务,是比较好用的国产软件。
网页版网址:
http://www.integle.com/static/indraw
桌面端下载:
桌面端的软件功能多一点。为了方便大家下载,桌面端的软件已上传到OmicShare论坛,点下面链接可到论坛下载。
链接:
http://www.omicshare.com/forum/thread-3946-1-1.html
操作技巧
1
结构式手工绘制
手工绘制的方法很简单,可以自由绘制想要的的结果,方法如下图(这里用桌面端进行演示)。绘制的图形元件框选(工具栏第1个工具)后,可以进行旋转,缩放等,也可以直接复制粘贴到Word、PPT中做插图使用,非常方便。
2
图片中原由网结构式识别
从网页中或文献中查到的结构式,如何能为我所用?若结构式比较复杂,用手工绘制的方法显然比较费时。而InDraw 具有识别图片中的结构式的功能,点击工具栏的 “剪刀”工具(最后1个),对结构式进行截图,点完成 即可生成图中的结构式,方法如下图。
当然,识别的准确率可能达不到100%,部分结构可能还需手工修改。
3
由名称//www.58yuanyou.com转化为结构式
点击任务栏的文本工具,输入物质名称(IUPAC命名法),框选文本后,右键/名称转结构,就会直接出结果,方法如下图。
图片保存
InDraw绘制的结构式可支持多种图片格式和分子格式,也支持ChemDraw的cdx格式(如下图)。有一点不够好的是不支持导出矢量图。
绘制的结构式虽可复制粘贴到word 、PPT中直接使用,但仍以位图的形式显示。当然,如果想要获得高分率的结构图也是有办法的,你可以在InDraw中选中结构式,整体放大后再复制粘贴或导出。
但很多时候,
身边没纸笔也没电脑
突然想画个结构式,怎么办呢?
你当然可以这样
但你有更好的选择哈!
可以使用这款手机版的结构式编辑器
叫做KingDraw
可直接至软件官网下载:http://www.kingdraw.cn/
是不是很棒呢?
轻松点击几下
就可以画出一个结构式
安装之后
点击右上角 “+” 新建画板
一个空白画板就建好了
即可开始编辑结构式
底部一栏可以左右滑动
选择不同的结构
单键双键 实线虚线
三元环 五元环 苯环
常用结构基本都有
多种的化学键、长链
环状化合物工具
绘制方便快捷
左侧一列为元素符号选项
点击三点
可以自主选择常用元素
可以直接分享给他人
本文来自:基迪奥生物公众号(ID:gene-denovo)、化学加公众号(ID:tryingchem)
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